La structure de DNS Belgium se présente de la manière suivante : 

• Assemblée générale :  se compose de tous les membres de l'ASBL et est autorisé, entre autres, à nommer les administrateurs de l'association et à approuver les comptes annuels. 
• Conseil d'administration (CA) : dirige l'association et la représente dans tous les actes judiciaires et extrajudiciaires. Les membres de l'association ont au moins un directeur dans cet organe.
• Comité financier : gère et contrôle les données financières de l'organisation en vue de la préparation des conseils d'administration.
• Comité de rémunération : il fixe les objectifs annuels et les primes correspondantes pour le directeur général, évalue les résultats obtenus et détermine le pourcentage de la prime. Le comité réfléchit aussi périodiquement à la stratégie de rémunération globale de DNS Belgium et tient compte de la cohésion entre la rémunération des cadres supérieurs et celle du directeur général lui-même.

Le directeur général de DNS Belgium s'appelle Philip Du Bois. Il :

• est chargé de la gestion journalière de l'association
• veille au bon déroulement des activités opérationnelles
• rapporte au conseil d'administration

Voici la liste de tous les membres de l'association.